Die histologische Diagnostik („histologische Untersuchung” = mikroskopische Gewebeuntersuchung) nimmt heute den größten Teil der Tätigkeit eines Pathologen ein. Neben Operationspräparaten werden auch bioptisch gewonnene Gewebeproben untersucht. Mit den in der histologischen Untersuchung gewonnenen Erkenntnissen trifft dann der behandelnde Arzt seine Entscheidung, wie die Therapie des Patienten weitergeht.